Ответ: Бьюсь над версткой!
Затык в том, что старый вариант (он нормальный) закончен, только он сделан не в том формате ( я имею ввиду, формат обрезной) и там некоторые нюансы с фотографиями.
А новый вариант, в нужном формате и с хорошими иллюстрациями не переводится в ПДФ вообще. А старый переводится, если не много страниц загружать, а частями.
Сейчас попробовала, вроде бы ничего получается. И в ПДФе все хорошо.