Ответ: Проблема со сносками.
Мне тоже достаётся много текстов научных книг с десятками сносок.
В конце 2009 года попалась монография с 94 сносками...
Во-первых, я сделал стиль "Сноска" вместо "стандартного" footnоter.
И присвоил этот стиль как стиль по умолчанию в Footnote Options.
Как известно, формат сноски такой
1) № - Superscript начертание
2) не пробел, а En (Сtrl+Shift+N)
3) слово, которое расшифровывается (я его обычно пишу вразрядку (трекинг +200))
4) Тонкий пробел Thin Space, ибо тире длинное далее
5) тире длинное
6) Тонкий пробел Thin Space
7) текст расшифровки
8) точка
Абзацный отступ - как в основном тексте.
Выключка - делаю по формату, левая. LeftJustified.
Если в тексте номер сноски не после запятой и не после точки, то от последнего символа до № сноски ставлю Thin Space (тонкий пробел).
Шрифт я выбираю на 1-1,5 пт меньше, чем основной текст.
(Не во всём могу быть прав, например по части точки в конце сноски, выключки текста сноски, а также Thin Space, т. к. перед № сноски надо вроде 2 пт пробел.)
Затем (у меня забито всё в шаблоне научной книги.)
сделал несколько Character Style -
такие:
а) для № сноски - ТэгНомерСноски (Suрerscript начертание)
б) ТэгСноскаПервоеСлово - текст вразрядку (+200)
в) ТекстСноски (простой текст, на 1-1,5 пт меньший, чем основной текст).
Затем в Nested Styles
прописал последовательность следования тэгов: "первое слово"=ТэгНомерСноски, затем "второе слово" ТэгСноскаПервоеСлово, затем до конца текста ТекстСноски (тире с окружающими его пробелами попадает в этот тэг).
Не забудьте назначить верную нумерацию сносок: с перенумерацией на каждой новой странице или не перенумеровывать (сквозная нумерация).
Я перетаскиваю тексты сносок через Блокнот, чтобы избежать попадания каких-либо управляющих символов.
Про рамки. Это могли быть следы гиперссылок типа
www.что-то.ru
Мне помогает Блокнот - вычищается это, без рамок идёт в текст.