Ответ: Cлетают пользовательские горячие клавиши
Если Keyboard Shortcuts не переназначаются, то возможно недавно Индюк стал 4.03 версией, и соответственно схватил глюка последнего апдейта.
Решение проблемы:
1. Открыть Keyboard shortcuts
2. Создать preset на основе какого-нибудь
3. В новом preset'е назначить какому-нибудь действию hotkey (обращаю внимание - с английской раскладкой клавы)
4. Перейти на другой preset, Индюк спросит насчет сохранения измений - ответить положительно. В данный момент глюк уходит, но файл с preset'ом где были внесены изменения остается ипорченным, поэтому удаляем его.