Ответ: Spot в СМУК в PDF-е
А в PDF мануале написано, что будет non-zero printing, если CMYK был задан напрямую, а не есть результат конвертации или вычислений.
Так что симуляция оверпринта полностью противоречит спецификациям PDF и правильный рип должен её отключать, если обрабатывает PDF/X.