Ответ: Поползли макеты
Первое — в Индизайне проверить, чтобы черный текст был Black 100%. Если с этим порядок, открыть ПДФ, Advanced\Print Production\Output Preview, отключить черный и посмотреть на текст: если он таки в 4 краски, значит перво-наперво проверить настройки профилей при экспорте...