Ответ: Сепаратный Пост Скрипт
Можно, например, так:
Открыть сепарированый PDF (любую страницу, главное, поставить CMYK), Выделить всё, удалить. Потом из закладки Channels выполнить команду Split.
Открыть снова его же на странице Cyan (но уже как Grey), выделить всё, скопировать в Cyan-овый...