Не совсем пойму, в чем проблема то
var myDocument=app.activeDocument;
var rect = myDocument.pages.item(0).rectangles.add({geometricBounds:[0,0,100,100]});
rect.fillColor.colorValue=[250,0,0];
Более того, обнаружил, что, оказывается это проблема проблем 'fp'