Ответ: InDesign закрывается! Помогите!
К сожалению, похоже, что да.
На будущее:
1. Всегда необходимо делать резервные копии этапов работы.
2. После сбоя, при предупреждении, о том что файл может быть поврежден, стараться не открывать его, а использовать последнюю сохраненную версию.