Генерирую автоматическое содержание. Если ставить галку Sort Entries in Alphabetical Order, TOC не различает Е и Ё. 
Язык текста русский, все виды штатных словарей (Hunspell, Proximity,  WinSoft) перебрал —  не влияет. Попробовал поверх пройтись скриптом SortParagraphs.jsx — он вообще все слова...