Ответ: Adobe Illustrator CS6 Оставляет сверху и слева 1px
Если включить Pixel Preview (Ctrl+Alt+Y), приблизить побольше и войти в режим редактирования артборда (Shift+O), то видно, как неточно стоит артборд по отношению к пиксельной решетке. Потом при сохранении для вэб, при включенной опции Art Optimized, появляются вот такие эффекты по краям.
Но если всё-таки выровнять артборд и сохранять для вэб, даже при Art Optimized, то всё будет нормально.