В чем верстаете?
Что касается вьювера - адобовский до сих пор некорректно показывает некоторые польские знаки в ePUB при псросмотре на РС. На айПаде эти же ePUB просматриваются корректно.
У меня разрывы страниц работают на всех доступных мне устройствах, в том числе на iBooks.
Вы уже второй участник, жалующийся на неработающие разрывы страниц. В чем дело - не знаю. У меня и свои и чужие ePUB работают с разрывами.
Возьмите чужой ePUB, такой с разрывами, и посмотрите XML, сравните со своим - те ли символы разрыва использованы у вас.