проблема исчезла сама так же непонятно, как и появилась
Все верно. Эта проблема существует во всех версиях ID, начиная с пакета CS3. В моем (CS6) она точно так же периодически возникает, отследить, с чем она связана за три года так и не удалось. Некоторые действия иной раз ее самопроизвольно решают, а в другой раз не срабатывают. Сброс до фабричных настроек от нее не избавляет. Единственное условие, при котором стрелочки гарантированно возвращаются — применение (на любом тексте) какого-нибудь скрипта для чистки текста. (Не уверен, что можно их называть или выкладывать, но догадаться, думаю, несложно.)