Ответ: Как бороться с кракозябами в окнах ввода?
Мне известно два способа. Первый — самый простой — поставить InDesign 2.0 CE. И второй — некрасивый — перед запуском InDesign 2.0 заводить русский PM6.5. Я не знаю, что он подкидывает в систему, но в диалоги становится возможным нормально вводить русский текст.