Непонятная задача.
Мастер-страницы — это страницы-шаблоны из которых потом можно быстро создать много типовых страниц с уже настроенными на них элементами, это для ускорения и упрощения работы. А вот сам документ может содержать только мастер-страницы [None], т.е. ко всем страницам не будет применена ни одна мастер-страница.
И тут вообще не понятно при чем мастер-страницы к секциям, и они оба при чем к ссылкам и каким-то префиксам.
Зачем вам префиксы мастер-страниц вообще?
Есть секции, есть номера страниц, есть перекрестные ссылки (Cross-References).
Если нужно структурировать документ, где будут разные секции (разделы) и у каждой секции своя нумерация, тогда и создавайте секции, называйте секции как вам надо, настраивайте нумерацию.
А ссылки вида "Продолжение смотри на с. 5А" можно реализовать через перекрестные ссылки: Продолжение смотри в секции [название секции] на стр. [номер страницы секции].