В акшн записывается Hide & Show для selected layer, запишите, назначьте акшнам шорткаты с разными контролами на один Function Key, и давите то контро+ваш кей для скрытия, то шифт+ваш кей для показа слоя.
Кстати, я не понял о чем вы выше говорили - нажатие цифр приводит к изменению Opacity слоя без альтов, а если выбран тулз в котором есть своя Opacity - то для его. Или у вас другая платформа?