На Mac OS удобнее использовать AppleScript. Он позволяет использовать несколько программ в пределах одного скрипта:
tell application "Adobe InDesign CS4"
-- Работа с индизайном, создаются требуемые файлы
end tell
tell application "Mail"
-- Создание и отправка почты
end tell
Если есть заготовки на JavaScript, то их легко вставить в тело скрипта, объявив, к примеру, переменную myJavaScript с текстом скрипта или путем к скрипту, а затем вызвать
do javascript myJavaScript