Какие цвета? Корел как и Шоп работает со всеми известными моделями цветов, а вы даже не указали какие. RGB,Lab,CMYK,CMY,HLS... у Корела побольше будет.
Если объект в RGB, и в Шопе надо его класть в RGB документ. CMYK в CMYK. Lab - Lab. И тогда сравнивать. И конечно никаких несовпадений быть не должно: если вы залили элемент объекта например R255G0B0, то если у вас при экспорте не лезут в дело никакие профили, то в Шопе должен быть точно такой же цвет; если залили C100M100Y0K20, и опять без профилей экспортировали, тоже самое - значения будут идентичными.
Другое дело что у вас в Кореле и Шопе _отображение_ цветов разное. Это можно настроить и будет совершенно одинаковое. О том как это сделать - где-то есть топики тут.
Экспортировать следует именно через EPS, без профилей. Растры из Корела НЕ надо экспортировать в большинстве случаев - просто перетаскиваете их в Шоп, но не на рабочий стол Шопа, а в открытый в нем документ. Если что-то не получается - тоже через EPS.
В опциях экспорта в EPS _отключить_ управление цветом!