Ответ: пропала прозрачность в .ai
Я не понимаю речь идет о прозрачности или об обтравке?
О прозрачности вместо обтравки.
А что есть
обтравка?
Читаем у Мильчина (Издательский словарь-справочник. М. Олма-Пресс. 2003):
Обтравка — удаление с
растрового клише точек фона, который, закрыв защитным лаком всё изображение, подвергают для этого доп. травлению. (Конец цитаты.)
То есть, обтравка это картинка без фона. Это картинка с прозрачным фоном, другими словами. Это растровая картинка (растрой объект) не прямоугольной формы.
Каким образом это сделано компьютерными средствами — не важно. В любом случае это будет
обтравка.
Если у обтравки должны быть чёткие границы, то лучше её делать, помещая растровую картинку в векторную маску. В PhS это Clipping Path, в AI это Clipping Mask, в Кореле это Power Clip и т.д.
Но помимо обтравки есть ещё и
растушёвка (у Мильчина не найдёте) — размытие края
обтравки.
В этом случае без прозрачности (альфа-канала, Opacity Mask и т.д.) не обойдёшься. Разве что в AI или InD к маске, в которую помещена картинка, применить эффект Feather.
Но лучше это сделать средствами PhS — «резинкой» или с помощью маски слоя удалить фон, т.е. сделать обтравку, где надо — размыть край обтравки, после чего по внешнему краю полученной
обтравки с растушёвкой создать Clipping Path.
Сохранить в PSD-файл и помещать в AI или InD.
При выводе, из-за наличия у такой картинки прозрачности, будет происходить «сплющивание», но векторная маска сократит до минимума площадь, под него попадающую.