Скоростью работы (ну вот зачем мне скрипт вывода треухровнего меню, если у меня будет одноуровневое?), простотой внедрения скриптов, подгрузкой только необходимых скриптов и стилей (один JQuery почти 100 килобайт;-), переверсткой макета отдельной страницы.