Насколько я понял суть вопроса, то речь банально о сохранении "в памяти квипа" (назовем это так) пути к используемому файлу. Проверить это легко: после того, как работу "съэнапили", попробуйте, не закрывая Акробат, удалить файл, который подкладывался. Это будет проблематично: система скажет, что файл занят.
Если же его всё-таки удалить, то при повторении алгоритма в акробате будет кучка матюков про "Not found".
Итак, варианта, казалось бы, два: либо изменить эту ссылку, "перебив её руками", либо изменить содержимое того файла, на который ссылка.
Однако, только что я попробовал повторить такой финт ушами с заменой (точнее, подменой) файла, но получил дулю с маком.
Проверял на многостраничном слиянии (под девять разных страниц одного документа подложить девять разных страниц другого документа), в итоге педаль "Finish" была неактивна и в записи "Sheets in new document" стоял "?".
Но мне такую лабораторную работу пришлось делать только ради лабораторной работы: откровенно не понимаю, что мешает заново прописать путь к новому файлу в рабочем режиме.