Ответ: Темный (черный) фон вокруг "вырезанного" EPS-изображения у FreeHand 11.0.2
Не любит fh eps, можно поставить eps в клипинг пасс выдернув его из самого его в шопе, но это не вариант при 200 картинках. Так что, все правильно, только через ПДФ. А лучше всего, если сам делаешь, продумать заранее.