Ответ: в чем разница?
Реально разницы быть не должно, но... Как всегда
Смотря как и из чего.
Разница в основном в PPD и контексте принтера.
Некоторые особенности принтера прописаны в PPD.
Некоторые настройки программа может брать (а может не брать) из контекста (настроек) принтера.
Когда вы делаете PDF через печать на PDF принтер, то пользуетесь контекстом этого принтера и, вероятно, его PPD. И это нужно понимать...
Основная особенность в данном случае, это поддерживаемые форматы бумаги, поддерживаемые типы шрифтов (это PPD), неполиграфические и старые программы (PageMaker) берут информацию о том, что делать, например, с TTF шрифтами из настроек принтера.
