Этот скрипт выравнивает все объекты на всех страницах документа по TOP.Нужен допиленный.
Если быть предельно точным, то скрипт вот такой:Точно то, что требовалось.
for (var i = 0; i < app.activeDocument.pages.everyItem().pageItems.everyItem().getElements().length; i++) {
    if (Math.random() < .5) {
        app.activeDocument.align(app.activeDocument.pages.everyItem().pageItems.everyItem().getElements()[i], DistributeOptions.TOP_EDGES, AlignDistributeBounds.PAGE_BOUNDS);
    } else {
        app.activeDocument.align(app.activeDocument.pages.everyItem().pageItems.everyItem().getElements()[i], DistributeOptions.BOTTOM_EDGES, AlignDistributeBounds.PAGE_BOUNDS)
    }
}
	Код:for (var i = 0; i < app.activeDocument.pages.everyItem().pageItems.everyItem().getElements().length; i++) { app.activeDocument.align(app.activeDocument.pages.everyItem().pageItems.everyItem().getElements()[i], DistributeOptions.TOP_EDGES, AlignDistributeBounds.PAGE_BOUNDS) }
Если быть предельно точным, то скрипт вот такой:
 дословно.  