Сделайте себе кнопки на панели ТС, это удобнее чем на панели задач, если им в основном пользуетесь.
Расскажите про удобства. Чего должно быть прописано в кнопке на панели ТС, чтобы был выбор открыть файл в уже запущенной программе или открыть новый экземпляр программы? Сейчас я кнопкой в ТС открываю новый экземпляр, а в запущенную прогу тащу через панель задач.
Пользую, но временами подглючивает — при перетаскивании непосредственно в окно программы, объект иногда "теряется", приходится тянуть ещё раз. Но у меня подключено 2 монитора, там вроде писали, что возможна некорректная работа в многомониторных системах.
В основном пользуюсь для AI, PS и ID, у них нет такого выбора
Все открывается в одном экземпляре программы. Прописан в кнопке в качестве команды просто путь к экзешнику... ничего такого Сложности только с AI, ибо CS6 при этом выходит из полнооконного режима 
что немного раздражает Вы видимо её жмете (что логично 
) А я на нее тащу файл(ы) Несколько файлов и правда нельзя сразу таким образом открыть, давно не пытался, вот и подзабыл 
%P%S, тогда и перетаскиванием один файл откроется и по нажатию можно открыть скопом все выделенные (что может и удобнее даже)