тут как раз не важно, какого рода переменка. просто есть 1 pdf на много полос, надо разобрать, пересортировать и собрать обратно.
про разобрать нашел: http://www.pdf-tools.com, хоть и без путей, но хоть можно указать дорожку к исходнику. а про собрать сложно — утилита из их же набора не...