Да, вручную, когда дизайн делается. Что бы его видно не было, выносится на отдельный слой, который затем скрывается. В АЕ он в нужный момент включается.Что то я не очень понял. Прямоугольник в ручную задается в файле? Что такое рут?
Это был частный пример.
У нас же как... страница может быть вертикальной, но при этом дизайн расположен горизонтально. Вот и столкнулся с тем, что нужно объяснить АЕ где "голова" и где "ноги" у дизайна, относительно страницы/кроя этикетки.