1. Неудобно как минимум тем, что скрипты и кучку замен приходится прогонять несколько раз по разным блокам.
2. Разбивка - лишняя трата времени и путаница. У меня, например, на верстку типовой книги допустим в 500 страниц уходит около 3-4 часов. Из них - ~1 час - это работа скриптами и заменами и 2-3 часа - быстренько пробежаться по страницам подтянуть-растянуть. Какой смысл менять отработанный на сотнях книг процесс?
У меня есть сложные тяжелые работы, где я разбиваю на куски. Но чернушные книги - не тот вариант