Я разбил пдф на 6 частей, создал 6 копий сверстанного документа (100 страничного), автоматом перелинковал эти части, экспортнул обратно в пдф и слил в один документ. Получилось 300 страниц пдф по две страницы на одном листе ))). Было бы круто все это автоматизировать одним скриптом.